Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
XIRP2A4UGR9 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
XIRP2A4UGR9 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
XIRP2A4UGR9 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
XIRP2A4UGR9 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
XIRP2A4UGR9 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
XIRP2A4UGR9 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
XIRP2A4UGR9 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
XIRP2A4UGR9 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
XIRP2A4UGR9 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
XIRP2A4UGR9 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
XIRP2A4UGR9 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
XIRP2A4UGR9 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
XIRP2A4UGR9 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
XIRP2A4UGR9 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
XIRP2A4UGR9 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
XIRP2A4UGR9 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
XIRP2A4UGR9 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
XIRP2A4UGR9 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
XIRP2A4UGR9 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
XIRP2A4UGR9 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
XIRP2A4UGR9 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
XIRP2A4UGR9 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
XIRP2A4UGR9 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
XIRP2A4UGR9 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
XIRP2A4UGR9 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
XIRP2A4UGR9 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
XIRP2A4UGR9 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
XIRP2A4UGR9 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
XIRP2A4UGR9 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
XIRP2A4UGR9 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
XIRP2A4UGR9 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
XIRP2A4UGR9 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
XIRP2A4UGR9 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
XIRP2A4UGR9 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
XIRP2A4UGR9 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
XIRP2A4UGR9 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
XIRP2A4UGR9 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
XIRP2A4UGR9 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
XIRP2A4UGR9 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
XIRP2A4UGR9 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
XIRP2A4UGR9 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
XIRP2A4UGR9 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
XIRP2A4UGR9 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
XIRP2A4UGR9 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
XIRP2A4UGR9 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
XIRP2A4UGR9 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
XIRP2A4UGR9 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
XIRP2A4UGR9 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
XIRP2A4UGR9 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
XIRP2A4UGR9 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
XIRP2A4UGR9 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
XIRP2A4UGR9 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
XIRP2A4UGR9 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
XIRP2A4UGR9 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
XIRP2A4UGR9 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
XIRP2A4UGR9 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
XIRP2A4UGR9 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
XIRP2A4UGR9 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
XIRP2A4UGR9 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
XIRP2A4UGR9 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
XIRP2A4UGR9 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
XIRP2A4UGR9 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
XIRP2A4UGR9 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
XIRP2A4UGR9 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
XIRP2A4UGR9 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
XIRP2A4UGR9 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
XIRP2A4UGR9 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
XIRP2A4UGR9 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
XIRP2A4UGR9 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
XIRP2A4UGR9 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
XIRP2A4UGR9 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
XIRP2A4UGR9 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
XIRP2A4UGR9 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
XIRP2A4UGR9 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
XIRP2A4UGR9 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
XIRP2A4UGR9 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
XIRP2A4UGR9 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
XIRP2A4UGR9 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
XIRP2A4UGR9 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
XIRP2A4UGR9 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
XIRP2A4UGR9 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
XIRP2A4UGR9 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
XIRP2A4UGR9 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
XIRP2A4UGR9 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
XIRP2A4UGR9 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
XIRP2A4UGR9 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
XIRP2A4UGR9 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
XIRP2A4UGR9 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
XIRP2A4UGR9 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
XIRP2A4UGR9 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
XIRP2A4UGR9 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
XIRP2A4UGR9 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
XIRP2A4UGR9 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
XIRP2A4UGR9 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
XIRP2A4UGR9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
XIRP2A4UGR9 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
XIRP2A4UGR9 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
XIRP2A4UGR9 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
XIRP2A4UGR9 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms