Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HMX2A2RU54 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HMX2A2RU54 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HMX2A2RU54 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HMX2A2RU54 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HMX2A2RU54 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HMX2A2RU54 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HMX2A2RU54 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HMX2A2RU54 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HMX2A2RU54 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HMX2A2RU54 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HMX2A2RU54 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HMX2A2RU54 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HMX2A2RU54 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HMX2A2RU54 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HMX2A2RU54 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HMX2A2RU54 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HMX2A2RU54 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HMX2A2RU54 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HMX2A2RU54 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HMX2A2RU54 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HMX2A2RU54 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HMX2A2RU54 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HMX2A2RU54 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HMX2A2RU54 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HMX2A2RU54 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMX2A2RU54 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMX2A2RU54 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMX2A2RU54 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMX2A2RU54 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMX2A2RU54 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HMX2A2RU54 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMX2A2RU54 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMX2A2RU54 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMX2A2RU54 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMX2A2RU54 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMX2A2RU54 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMX2A2RU54 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMX2A2RU54 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HMX2A2RU54 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMX2A2RU54 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMX2A2RU54 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMX2A2RU54 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMX2A2RU54 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMX2A2RU54 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMX2A2RU54 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMX2A2RU54 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMX2A2RU54 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMX2A2RU54 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HMX2A2RU54 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HMX2A2RU54 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMX2A2RU54 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMX2A2RU54 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMX2A2RU54 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMX2A2RU54 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMX2A2RU54 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMX2A2RU54 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMX2A2RU54 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMX2A2RU54 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMX2A2RU54 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMX2A2RU54 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HMX2A2RU54 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HMX2A2RU54 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HMX2A2RU54 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HMX2A2RU54 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HMX2A2RU54 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HMX2A2RU54 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HMX2A2RU54 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HMX2A2RU54 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HMX2A2RU54 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HMX2A2RU54 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HMX2A2RU54 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HMX2A2RU54 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HMX2A2RU54 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HMX2A2RU54 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HMX2A2RU54 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HMX2A2RU54 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HMX2A2RU54 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HMX2A2RU54 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HMX2A2RU54 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HMX2A2RU54 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HMX2A2RU54 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
HMX2A2RU54 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HMX2A2RU54 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
HMX2A2RU54 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
HMX2A2RU54 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HMX2A2RU54 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HMX2A2RU54 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HMX2A2RU54 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HMX2A2RU54 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HMX2A2RU54 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
HMX2A2RU54 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HMX2A2RU54 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HMX2A2RU54 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HMX2A2RU54 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HMX2A2RU54 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HMX2A2RU54 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HMX2A2RU54 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HMX2A2RU54 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HMX2A2RU54 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms