Protein–RNA interactions for Protein: A2A3N6

PIPSL, Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPSLA2A3N6 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PIPSLA2A3N6 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PIPSLA2A3N6 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PIPSLA2A3N6 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PIPSLA2A3N6 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PIPSLA2A3N6 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PIPSLA2A3N6 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PIPSLA2A3N6 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PIPSLA2A3N6 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PIPSLA2A3N6 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PIPSLA2A3N6 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PIPSLA2A3N6 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PIPSLA2A3N6 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PIPSLA2A3N6 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PIPSLA2A3N6 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PIPSLA2A3N6 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PIPSLA2A3N6 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PIPSLA2A3N6 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PIPSLA2A3N6 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PIPSLA2A3N6 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PIPSLA2A3N6 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PIPSLA2A3N6 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PIPSLA2A3N6 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PIPSLA2A3N6 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PIPSLA2A3N6 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PIPSLA2A3N6 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PIPSLA2A3N6 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PIPSLA2A3N6 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PIPSLA2A3N6 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PIPSLA2A3N6 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PIPSLA2A3N6 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PIPSLA2A3N6 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PIPSLA2A3N6 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PIPSLA2A3N6 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PIPSLA2A3N6 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PIPSLA2A3N6 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PIPSLA2A3N6 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PIPSLA2A3N6 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PIPSLA2A3N6 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PIPSLA2A3N6 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PIPSLA2A3N6 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PIPSLA2A3N6 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PIPSLA2A3N6 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PIPSLA2A3N6 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PIPSLA2A3N6 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PIPSLA2A3N6 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PIPSLA2A3N6 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PIPSLA2A3N6 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PIPSLA2A3N6 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PIPSLA2A3N6 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PIPSLA2A3N6 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PIPSLA2A3N6 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PIPSLA2A3N6 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PIPSLA2A3N6 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PIPSLA2A3N6 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PIPSLA2A3N6 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PIPSLA2A3N6 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PIPSLA2A3N6 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PIPSLA2A3N6 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PIPSLA2A3N6 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PIPSLA2A3N6 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PIPSLA2A3N6 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PIPSLA2A3N6 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PIPSLA2A3N6 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PIPSLA2A3N6 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms