Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WT01

TRAV27, T-cell receptor alpha variable 27 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAV27A0A087WT01 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms