Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R1

SLC4A4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A4Q9Y6R1 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC4A4Q9Y6R1 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC4A4Q9Y6R1 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC4A4Q9Y6R1 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC4A4Q9Y6R1 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC4A4Q9Y6R1 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC4A4Q9Y6R1 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC4A4Q9Y6R1 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC4A4Q9Y6R1 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC4A4Q9Y6R1 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC4A4Q9Y6R1 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC4A4Q9Y6R1 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC4A4Q9Y6R1 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC4A4Q9Y6R1 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC4A4Q9Y6R1 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC4A4Q9Y6R1 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC4A4Q9Y6R1 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC4A4Q9Y6R1 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC4A4Q9Y6R1 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC4A4Q9Y6R1 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC4A4Q9Y6R1 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC4A4Q9Y6R1 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC4A4Q9Y6R1 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC4A4Q9Y6R1 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC4A4Q9Y6R1 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms