Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5M8

SRPRB, Signal recognition particle receptor subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRBQ9Y5M8 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRPRBQ9Y5M8 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRPRBQ9Y5M8 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRPRBQ9Y5M8 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRPRBQ9Y5M8 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRPRBQ9Y5M8 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRPRBQ9Y5M8 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRPRBQ9Y5M8 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRPRBQ9Y5M8 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRPRBQ9Y5M8 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRPRBQ9Y5M8 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRPRBQ9Y5M8 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRPRBQ9Y5M8 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SRPRBQ9Y5M8 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SRPRBQ9Y5M8 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SRPRBQ9Y5M8 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SRPRBQ9Y5M8 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SRPRBQ9Y5M8 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRPRBQ9Y5M8 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRPRBQ9Y5M8 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRPRBQ9Y5M8 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRPRBQ9Y5M8 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRPRBQ9Y5M8 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRPRBQ9Y5M8 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRPRBQ9Y5M8 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRPRBQ9Y5M8 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SRPRBQ9Y5M8 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRPRBQ9Y5M8 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRPRBQ9Y5M8 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRPRBQ9Y5M8 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRPRBQ9Y5M8 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SRPRBQ9Y5M8 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRPRBQ9Y5M8 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRPRBQ9Y5M8 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRPRBQ9Y5M8 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRPRBQ9Y5M8 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRPRBQ9Y5M8 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRPRBQ9Y5M8 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRPRBQ9Y5M8 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRPRBQ9Y5M8 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRPRBQ9Y5M8 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRPRBQ9Y5M8 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRPRBQ9Y5M8 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRPRBQ9Y5M8 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRPRBQ9Y5M8 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRPRBQ9Y5M8 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRPRBQ9Y5M8 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRPRBQ9Y5M8 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRPRBQ9Y5M8 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRPRBQ9Y5M8 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRPRBQ9Y5M8 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRPRBQ9Y5M8 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRPRBQ9Y5M8 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRPRBQ9Y5M8 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRPRBQ9Y5M8 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRPRBQ9Y5M8 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SRPRBQ9Y5M8 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRPRBQ9Y5M8 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRPRBQ9Y5M8 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRPRBQ9Y5M8 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SRPRBQ9Y5M8 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRPRBQ9Y5M8 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SRPRBQ9Y5M8 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRPRBQ9Y5M8 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRPRBQ9Y5M8 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRPRBQ9Y5M8 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRPRBQ9Y5M8 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRPRBQ9Y5M8 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRPRBQ9Y5M8 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRPRBQ9Y5M8 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRPRBQ9Y5M8 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRPRBQ9Y5M8 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRPRBQ9Y5M8 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRPRBQ9Y5M8 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRPRBQ9Y5M8 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRPRBQ9Y5M8 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRPRBQ9Y5M8 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRPRBQ9Y5M8 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRPRBQ9Y5M8 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRPRBQ9Y5M8 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SRPRBQ9Y5M8 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRPRBQ9Y5M8 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRPRBQ9Y5M8 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRPRBQ9Y5M8 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRPRBQ9Y5M8 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRPRBQ9Y5M8 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SRPRBQ9Y5M8 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SRPRBQ9Y5M8 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRPRBQ9Y5M8 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRPRBQ9Y5M8 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRPRBQ9Y5M8 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRPRBQ9Y5M8 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRPRBQ9Y5M8 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SRPRBQ9Y5M8 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRPRBQ9Y5M8 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRPRBQ9Y5M8 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRPRBQ9Y5M8 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRPRBQ9Y5M8 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRPRBQ9Y5M8 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRPRBQ9Y5M8 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms