Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
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SH3BP1Q9Y3L3 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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