Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP8A1Q9Y2Q0 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP8A1Q9Y2Q0 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP8A1Q9Y2Q0 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP8A1Q9Y2Q0 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP8A1Q9Y2Q0 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP8A1Q9Y2Q0 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP8A1Q9Y2Q0 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP8A1Q9Y2Q0 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP8A1Q9Y2Q0 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP8A1Q9Y2Q0 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP8A1Q9Y2Q0 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP8A1Q9Y2Q0 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP8A1Q9Y2Q0 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP8A1Q9Y2Q0 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP8A1Q9Y2Q0 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP8A1Q9Y2Q0 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP8A1Q9Y2Q0 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP8A1Q9Y2Q0 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP8A1Q9Y2Q0 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP8A1Q9Y2Q0 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP8A1Q9Y2Q0 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP8A1Q9Y2Q0 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP8A1Q9Y2Q0 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP8A1Q9Y2Q0 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP8A1Q9Y2Q0 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP8A1Q9Y2Q0 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP8A1Q9Y2Q0 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP8A1Q9Y2Q0 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP8A1Q9Y2Q0 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP8A1Q9Y2Q0 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP8A1Q9Y2Q0 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP8A1Q9Y2Q0 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP8A1Q9Y2Q0 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP8A1Q9Y2Q0 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP8A1Q9Y2Q0 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP8A1Q9Y2Q0 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP8A1Q9Y2Q0 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP8A1Q9Y2Q0 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP8A1Q9Y2Q0 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP8A1Q9Y2Q0 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP8A1Q9Y2Q0 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP8A1Q9Y2Q0 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP8A1Q9Y2Q0 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP8A1Q9Y2Q0 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP8A1Q9Y2Q0 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP8A1Q9Y2Q0 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP8A1Q9Y2Q0 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP8A1Q9Y2Q0 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP8A1Q9Y2Q0 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP8A1Q9Y2Q0 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP8A1Q9Y2Q0 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP8A1Q9Y2Q0 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP8A1Q9Y2Q0 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP8A1Q9Y2Q0 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP8A1Q9Y2Q0 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP8A1Q9Y2Q0 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP8A1Q9Y2Q0 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP8A1Q9Y2Q0 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP8A1Q9Y2Q0 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP8A1Q9Y2Q0 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP8A1Q9Y2Q0 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP8A1Q9Y2Q0 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP8A1Q9Y2Q0 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP8A1Q9Y2Q0 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP8A1Q9Y2Q0 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP8A1Q9Y2Q0 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP8A1Q9Y2Q0 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP8A1Q9Y2Q0 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP8A1Q9Y2Q0 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP8A1Q9Y2Q0 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP8A1Q9Y2Q0 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP8A1Q9Y2Q0 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP8A1Q9Y2Q0 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP8A1Q9Y2Q0 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP8A1Q9Y2Q0 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP8A1Q9Y2Q0 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP8A1Q9Y2Q0 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP8A1Q9Y2Q0 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP8A1Q9Y2Q0 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP8A1Q9Y2Q0 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP8A1Q9Y2Q0 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP8A1Q9Y2Q0 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP8A1Q9Y2Q0 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP8A1Q9Y2Q0 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP8A1Q9Y2Q0 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP8A1Q9Y2Q0 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP8A1Q9Y2Q0 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP8A1Q9Y2Q0 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP8A1Q9Y2Q0 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP8A1Q9Y2Q0 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP8A1Q9Y2Q0 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP8A1Q9Y2Q0 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP8A1Q9Y2Q0 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP8A1Q9Y2Q0 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP8A1Q9Y2Q0 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms