Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms