Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms