Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms