Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.6 ms