Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM07

PADI4, Protein-arginine deiminase type-4, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI4Q9UM07 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PADI4Q9UM07 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PADI4Q9UM07 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PADI4Q9UM07 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PADI4Q9UM07 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PADI4Q9UM07 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PADI4Q9UM07 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PADI4Q9UM07 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PADI4Q9UM07 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PADI4Q9UM07 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PADI4Q9UM07 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PADI4Q9UM07 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PADI4Q9UM07 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PADI4Q9UM07 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PADI4Q9UM07 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PADI4Q9UM07 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PADI4Q9UM07 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PADI4Q9UM07 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PADI4Q9UM07 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PADI4Q9UM07 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PADI4Q9UM07 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PADI4Q9UM07 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PADI4Q9UM07 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PADI4Q9UM07 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PADI4Q9UM07 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PADI4Q9UM07 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PADI4Q9UM07 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PADI4Q9UM07 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PADI4Q9UM07 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PADI4Q9UM07 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PADI4Q9UM07 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PADI4Q9UM07 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PADI4Q9UM07 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PADI4Q9UM07 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PADI4Q9UM07 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PADI4Q9UM07 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PADI4Q9UM07 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PADI4Q9UM07 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PADI4Q9UM07 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PADI4Q9UM07 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PADI4Q9UM07 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PADI4Q9UM07 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PADI4Q9UM07 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PADI4Q9UM07 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PADI4Q9UM07 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PADI4Q9UM07 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PADI4Q9UM07 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PADI4Q9UM07 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PADI4Q9UM07 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PADI4Q9UM07 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PADI4Q9UM07 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PADI4Q9UM07 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PADI4Q9UM07 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PADI4Q9UM07 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PADI4Q9UM07 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PADI4Q9UM07 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PADI4Q9UM07 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PADI4Q9UM07 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PADI4Q9UM07 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PADI4Q9UM07 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PADI4Q9UM07 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PADI4Q9UM07 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PADI4Q9UM07 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PADI4Q9UM07 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PADI4Q9UM07 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PADI4Q9UM07 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PADI4Q9UM07 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PADI4Q9UM07 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PADI4Q9UM07 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PADI4Q9UM07 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PADI4Q9UM07 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PADI4Q9UM07 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PADI4Q9UM07 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PADI4Q9UM07 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PADI4Q9UM07 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PADI4Q9UM07 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PADI4Q9UM07 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PADI4Q9UM07 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PADI4Q9UM07 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PADI4Q9UM07 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PADI4Q9UM07 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PADI4Q9UM07 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PADI4Q9UM07 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PADI4Q9UM07 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PADI4Q9UM07 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PADI4Q9UM07 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PADI4Q9UM07 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PADI4Q9UM07 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PADI4Q9UM07 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PADI4Q9UM07 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PADI4Q9UM07 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PADI4Q9UM07 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PADI4Q9UM07 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PADI4Q9UM07 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PADI4Q9UM07 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PADI4Q9UM07 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PADI4Q9UM07 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PADI4Q9UM07 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PADI4Q9UM07 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PADI4Q9UM07 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms