Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms