Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD9

ZNF608, Zinc finger protein 608, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF608Q9ULD9 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZNF608Q9ULD9 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZNF608Q9ULD9 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZNF608Q9ULD9 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZNF608Q9ULD9 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
ZNF608Q9ULD9 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZNF608Q9ULD9 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZNF608Q9ULD9 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZNF608Q9ULD9 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZNF608Q9ULD9 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZNF608Q9ULD9 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZNF608Q9ULD9 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZNF608Q9ULD9 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZNF608Q9ULD9 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZNF608Q9ULD9 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZNF608Q9ULD9 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
ZNF608Q9ULD9 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZNF608Q9ULD9 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZNF608Q9ULD9 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
ZNF608Q9ULD9 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZNF608Q9ULD9 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZNF608Q9ULD9 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZNF608Q9ULD9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZNF608Q9ULD9 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZNF608Q9ULD9 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZNF608Q9ULD9 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZNF608Q9ULD9 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZNF608Q9ULD9 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZNF608Q9ULD9 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
ZNF608Q9ULD9 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZNF608Q9ULD9 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZNF608Q9ULD9 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZNF608Q9ULD9 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZNF608Q9ULD9 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZNF608Q9ULD9 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZNF608Q9ULD9 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZNF608Q9ULD9 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZNF608Q9ULD9 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZNF608Q9ULD9 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZNF608Q9ULD9 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZNF608Q9ULD9 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
ZNF608Q9ULD9 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZNF608Q9ULD9 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZNF608Q9ULD9 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZNF608Q9ULD9 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZNF608Q9ULD9 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZNF608Q9ULD9 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZNF608Q9ULD9 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZNF608Q9ULD9 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZNF608Q9ULD9 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms