Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL01

DSE, Dermatan-sulfate epimerase, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSEQ9UL01 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DSEQ9UL01 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DSEQ9UL01 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
DSEQ9UL01 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
DSEQ9UL01 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DSEQ9UL01 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DSEQ9UL01 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DSEQ9UL01 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
DSEQ9UL01 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DSEQ9UL01 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DSEQ9UL01 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DSEQ9UL01 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DSEQ9UL01 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DSEQ9UL01 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DSEQ9UL01 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DSEQ9UL01 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DSEQ9UL01 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DSEQ9UL01 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DSEQ9UL01 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DSEQ9UL01 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DSEQ9UL01 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DSEQ9UL01 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
DSEQ9UL01 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
DSEQ9UL01 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DSEQ9UL01 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DSEQ9UL01 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DSEQ9UL01 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DSEQ9UL01 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DSEQ9UL01 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DSEQ9UL01 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DSEQ9UL01 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DSEQ9UL01 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DSEQ9UL01 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DSEQ9UL01 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DSEQ9UL01 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DSEQ9UL01 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DSEQ9UL01 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DSEQ9UL01 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DSEQ9UL01 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DSEQ9UL01 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DSEQ9UL01 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DSEQ9UL01 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DSEQ9UL01 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DSEQ9UL01 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DSEQ9UL01 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DSEQ9UL01 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DSEQ9UL01 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DSEQ9UL01 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DSEQ9UL01 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
DSEQ9UL01 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DSEQ9UL01 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DSEQ9UL01 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DSEQ9UL01 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DSEQ9UL01 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
DSEQ9UL01 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DSEQ9UL01 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DSEQ9UL01 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
DSEQ9UL01 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DSEQ9UL01 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DSEQ9UL01 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DSEQ9UL01 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DSEQ9UL01 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DSEQ9UL01 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
DSEQ9UL01 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DSEQ9UL01 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DSEQ9UL01 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DSEQ9UL01 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DSEQ9UL01 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
DSEQ9UL01 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DSEQ9UL01 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DSEQ9UL01 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DSEQ9UL01 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
DSEQ9UL01 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
DSEQ9UL01 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
DSEQ9UL01 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
DSEQ9UL01 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
DSEQ9UL01 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
DSEQ9UL01 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
DSEQ9UL01 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
DSEQ9UL01 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
DSEQ9UL01 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
DSEQ9UL01 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
DSEQ9UL01 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
DSEQ9UL01 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
DSEQ9UL01 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
DSEQ9UL01 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
DSEQ9UL01 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
DSEQ9UL01 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
DSEQ9UL01 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
DSEQ9UL01 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
DSEQ9UL01 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
DSEQ9UL01 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
DSEQ9UL01 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
DSEQ9UL01 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
DSEQ9UL01 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
DSEQ9UL01 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
DSEQ9UL01 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
DSEQ9UL01 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
DSEQ9UL01 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
DSEQ9UL01 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms