Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG9

CROT, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROTQ9UKG9 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms