Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKE5

TNIK, TRAF2 and NCK-interacting protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIKQ9UKE5 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TNIKQ9UKE5 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TNIKQ9UKE5 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TNIKQ9UKE5 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TNIKQ9UKE5 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TNIKQ9UKE5 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
TNIKQ9UKE5 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TNIKQ9UKE5 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TNIKQ9UKE5 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TNIKQ9UKE5 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
TNIKQ9UKE5 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
TNIKQ9UKE5 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
TNIKQ9UKE5 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TNIKQ9UKE5 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TNIKQ9UKE5 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TNIKQ9UKE5 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TNIKQ9UKE5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TNIKQ9UKE5 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TNIKQ9UKE5 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TNIKQ9UKE5 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TNIKQ9UKE5 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TNIKQ9UKE5 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
TNIKQ9UKE5 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TNIKQ9UKE5 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TNIKQ9UKE5 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TNIKQ9UKE5 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TNIKQ9UKE5 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms