Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK80

USP21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21Q9UK80 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP21Q9UK80 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP21Q9UK80 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP21Q9UK80 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP21Q9UK80 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP21Q9UK80 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP21Q9UK80 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP21Q9UK80 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP21Q9UK80 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP21Q9UK80 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP21Q9UK80 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP21Q9UK80 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP21Q9UK80 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP21Q9UK80 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP21Q9UK80 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP21Q9UK80 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP21Q9UK80 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP21Q9UK80 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP21Q9UK80 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP21Q9UK80 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP21Q9UK80 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP21Q9UK80 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP21Q9UK80 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP21Q9UK80 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP21Q9UK80 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP21Q9UK80 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP21Q9UK80 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP21Q9UK80 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
USP21Q9UK80 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP21Q9UK80 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
USP21Q9UK80 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP21Q9UK80 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP21Q9UK80 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP21Q9UK80 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
USP21Q9UK80 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
USP21Q9UK80 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP21Q9UK80 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP21Q9UK80 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
USP21Q9UK80 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP21Q9UK80 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP21Q9UK80 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP21Q9UK80 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP21Q9UK80 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP21Q9UK80 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP21Q9UK80 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP21Q9UK80 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP21Q9UK80 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP21Q9UK80 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP21Q9UK80 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP21Q9UK80 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP21Q9UK80 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP21Q9UK80 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP21Q9UK80 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP21Q9UK80 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
USP21Q9UK80 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
USP21Q9UK80 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP21Q9UK80 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
USP21Q9UK80 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP21Q9UK80 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP21Q9UK80 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
USP21Q9UK80 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP21Q9UK80 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP21Q9UK80 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
USP21Q9UK80 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
USP21Q9UK80 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
USP21Q9UK80 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP21Q9UK80 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP21Q9UK80 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP21Q9UK80 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP21Q9UK80 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP21Q9UK80 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP21Q9UK80 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP21Q9UK80 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
USP21Q9UK80 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP21Q9UK80 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP21Q9UK80 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP21Q9UK80 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP21Q9UK80 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP21Q9UK80 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP21Q9UK80 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP21Q9UK80 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP21Q9UK80 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP21Q9UK80 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP21Q9UK80 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP21Q9UK80 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP21Q9UK80 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP21Q9UK80 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
USP21Q9UK80 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP21Q9UK80 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP21Q9UK80 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP21Q9UK80 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP21Q9UK80 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP21Q9UK80 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP21Q9UK80 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP21Q9UK80 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP21Q9UK80 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP21Q9UK80 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP21Q9UK80 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP21Q9UK80 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP21Q9UK80 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms