Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms