Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR5

CKLF, Chemokine-like factor, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKLFQ9UBR5 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms