Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms