Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms