Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J2

IGSF9, Protein turtle homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9Q9P2J2 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IGSF9Q9P2J2 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IGSF9Q9P2J2 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IGSF9Q9P2J2 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IGSF9Q9P2J2 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IGSF9Q9P2J2 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IGSF9Q9P2J2 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
IGSF9Q9P2J2 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IGSF9Q9P2J2 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
IGSF9Q9P2J2 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
IGSF9Q9P2J2 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IGSF9Q9P2J2 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IGSF9Q9P2J2 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IGSF9Q9P2J2 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IGSF9Q9P2J2 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
IGSF9Q9P2J2 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IGSF9Q9P2J2 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IGSF9Q9P2J2 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IGSF9Q9P2J2 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IGSF9Q9P2J2 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IGSF9Q9P2J2 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IGSF9Q9P2J2 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IGSF9Q9P2J2 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IGSF9Q9P2J2 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IGSF9Q9P2J2 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IGSF9Q9P2J2 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IGSF9Q9P2J2 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IGSF9Q9P2J2 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IGSF9Q9P2J2 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IGSF9Q9P2J2 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IGSF9Q9P2J2 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
IGSF9Q9P2J2 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IGSF9Q9P2J2 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
IGSF9Q9P2J2 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
IGSF9Q9P2J2 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
IGSF9Q9P2J2 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IGSF9Q9P2J2 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
IGSF9Q9P2J2 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
IGSF9Q9P2J2 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
IGSF9Q9P2J2 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IGSF9Q9P2J2 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IGSF9Q9P2J2 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
IGSF9Q9P2J2 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
IGSF9Q9P2J2 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IGSF9Q9P2J2 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
IGSF9Q9P2J2 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IGSF9Q9P2J2 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IGSF9Q9P2J2 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IGSF9Q9P2J2 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IGSF9Q9P2J2 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IGSF9Q9P2J2 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IGSF9Q9P2J2 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IGSF9Q9P2J2 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IGSF9Q9P2J2 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IGSF9Q9P2J2 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IGSF9Q9P2J2 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IGSF9Q9P2J2 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IGSF9Q9P2J2 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IGSF9Q9P2J2 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IGSF9Q9P2J2 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
IGSF9Q9P2J2 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IGSF9Q9P2J2 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IGSF9Q9P2J2 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IGSF9Q9P2J2 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IGSF9Q9P2J2 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IGSF9Q9P2J2 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IGSF9Q9P2J2 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IGSF9Q9P2J2 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IGSF9Q9P2J2 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IGSF9Q9P2J2 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IGSF9Q9P2J2 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IGSF9Q9P2J2 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IGSF9Q9P2J2 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IGSF9Q9P2J2 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IGSF9Q9P2J2 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IGSF9Q9P2J2 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IGSF9Q9P2J2 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IGSF9Q9P2J2 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IGSF9Q9P2J2 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IGSF9Q9P2J2 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
IGSF9Q9P2J2 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IGSF9Q9P2J2 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IGSF9Q9P2J2 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IGSF9Q9P2J2 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IGSF9Q9P2J2 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
IGSF9Q9P2J2 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IGSF9Q9P2J2 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IGSF9Q9P2J2 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IGSF9Q9P2J2 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IGSF9Q9P2J2 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IGSF9Q9P2J2 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
IGSF9Q9P2J2 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IGSF9Q9P2J2 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IGSF9Q9P2J2 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IGSF9Q9P2J2 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IGSF9Q9P2J2 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IGSF9Q9P2J2 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IGSF9Q9P2J2 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IGSF9Q9P2J2 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IGSF9Q9P2J2 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms