Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2D6

FAM135A, Protein FAM135A, humanhuman

Predictions only

Length 1,515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM135AQ9P2D6 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FAM135AQ9P2D6 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FAM135AQ9P2D6 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
FAM135AQ9P2D6 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
FAM135AQ9P2D6 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
FAM135AQ9P2D6 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
FAM135AQ9P2D6 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
FAM135AQ9P2D6 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC26■■□□□ 1.75
FAM135AQ9P2D6 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC26■■□□□ 1.75
FAM135AQ9P2D6 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
FAM135AQ9P2D6 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
FAM135AQ9P2D6 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
FAM135AQ9P2D6 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FAM135AQ9P2D6 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FAM135AQ9P2D6 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FAM135AQ9P2D6 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC26■■□□□ 1.75
FAM135AQ9P2D6 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FAM135AQ9P2D6 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
FAM135AQ9P2D6 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FAM135AQ9P2D6 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAM135AQ9P2D6 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAM135AQ9P2D6 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAM135AQ9P2D6 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAM135AQ9P2D6 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAM135AQ9P2D6 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAM135AQ9P2D6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAM135AQ9P2D6 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAM135AQ9P2D6 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAM135AQ9P2D6 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAM135AQ9P2D6 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAM135AQ9P2D6 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAM135AQ9P2D6 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAM135AQ9P2D6 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAM135AQ9P2D6 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAM135AQ9P2D6 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAM135AQ9P2D6 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAM135AQ9P2D6 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAM135AQ9P2D6 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAM135AQ9P2D6 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAM135AQ9P2D6 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAM135AQ9P2D6 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAM135AQ9P2D6 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAM135AQ9P2D6 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAM135AQ9P2D6 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAM135AQ9P2D6 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAM135AQ9P2D6 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAM135AQ9P2D6 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FAM135AQ9P2D6 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FAM135AQ9P2D6 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
FAM135AQ9P2D6 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FAM135AQ9P2D6 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FAM135AQ9P2D6 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FAM135AQ9P2D6 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FAM135AQ9P2D6 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FAM135AQ9P2D6 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FAM135AQ9P2D6 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FAM135AQ9P2D6 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FAM135AQ9P2D6 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FAM135AQ9P2D6 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FAM135AQ9P2D6 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FAM135AQ9P2D6 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
FAM135AQ9P2D6 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FAM135AQ9P2D6 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FAM135AQ9P2D6 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
FAM135AQ9P2D6 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FAM135AQ9P2D6 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
FAM135AQ9P2D6 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FAM135AQ9P2D6 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FAM135AQ9P2D6 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FAM135AQ9P2D6 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FAM135AQ9P2D6 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
FAM135AQ9P2D6 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FAM135AQ9P2D6 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FAM135AQ9P2D6 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FAM135AQ9P2D6 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
FAM135AQ9P2D6 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FAM135AQ9P2D6 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FAM135AQ9P2D6 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FAM135AQ9P2D6 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FAM135AQ9P2D6 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FAM135AQ9P2D6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FAM135AQ9P2D6 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FAM135AQ9P2D6 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FAM135AQ9P2D6 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FAM135AQ9P2D6 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FAM135AQ9P2D6 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FAM135AQ9P2D6 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FAM135AQ9P2D6 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FAM135AQ9P2D6 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FAM135AQ9P2D6 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FAM135AQ9P2D6 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
FAM135AQ9P2D6 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FAM135AQ9P2D6 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FAM135AQ9P2D6 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FAM135AQ9P2D6 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FAM135AQ9P2D6 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FAM135AQ9P2D6 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FAM135AQ9P2D6 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FAM135AQ9P2D6 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FAM135AQ9P2D6 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms