Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ71

RTEL1, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1Q9NZ71 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RTEL1Q9NZ71 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RTEL1Q9NZ71 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RTEL1Q9NZ71 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RTEL1Q9NZ71 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RTEL1Q9NZ71 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RTEL1Q9NZ71 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
RTEL1Q9NZ71 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RTEL1Q9NZ71 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RTEL1Q9NZ71 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
RTEL1Q9NZ71 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RTEL1Q9NZ71 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RTEL1Q9NZ71 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RTEL1Q9NZ71 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RTEL1Q9NZ71 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RTEL1Q9NZ71 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RTEL1Q9NZ71 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RTEL1Q9NZ71 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RTEL1Q9NZ71 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RTEL1Q9NZ71 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
RTEL1Q9NZ71 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RTEL1Q9NZ71 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RTEL1Q9NZ71 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RTEL1Q9NZ71 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RTEL1Q9NZ71 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RTEL1Q9NZ71 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RTEL1Q9NZ71 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RTEL1Q9NZ71 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RTEL1Q9NZ71 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RTEL1Q9NZ71 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RTEL1Q9NZ71 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RTEL1Q9NZ71 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RTEL1Q9NZ71 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RTEL1Q9NZ71 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RTEL1Q9NZ71 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RTEL1Q9NZ71 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
RTEL1Q9NZ71 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
RTEL1Q9NZ71 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RTEL1Q9NZ71 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RTEL1Q9NZ71 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RTEL1Q9NZ71 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RTEL1Q9NZ71 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RTEL1Q9NZ71 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RTEL1Q9NZ71 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RTEL1Q9NZ71 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RTEL1Q9NZ71 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
RTEL1Q9NZ71 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RTEL1Q9NZ71 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RTEL1Q9NZ71 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RTEL1Q9NZ71 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RTEL1Q9NZ71 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RTEL1Q9NZ71 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RTEL1Q9NZ71 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RTEL1Q9NZ71 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RTEL1Q9NZ71 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RTEL1Q9NZ71 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RTEL1Q9NZ71 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
RTEL1Q9NZ71 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RTEL1Q9NZ71 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RTEL1Q9NZ71 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RTEL1Q9NZ71 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RTEL1Q9NZ71 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RTEL1Q9NZ71 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RTEL1Q9NZ71 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
RTEL1Q9NZ71 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RTEL1Q9NZ71 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RTEL1Q9NZ71 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RTEL1Q9NZ71 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RTEL1Q9NZ71 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RTEL1Q9NZ71 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RTEL1Q9NZ71 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RTEL1Q9NZ71 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RTEL1Q9NZ71 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RTEL1Q9NZ71 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RTEL1Q9NZ71 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RTEL1Q9NZ71 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RTEL1Q9NZ71 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RTEL1Q9NZ71 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RTEL1Q9NZ71 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RTEL1Q9NZ71 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RTEL1Q9NZ71 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RTEL1Q9NZ71 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RTEL1Q9NZ71 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RTEL1Q9NZ71 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RTEL1Q9NZ71 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RTEL1Q9NZ71 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RTEL1Q9NZ71 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RTEL1Q9NZ71 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RTEL1Q9NZ71 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RTEL1Q9NZ71 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RTEL1Q9NZ71 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RTEL1Q9NZ71 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RTEL1Q9NZ71 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RTEL1Q9NZ71 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RTEL1Q9NZ71 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RTEL1Q9NZ71 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RTEL1Q9NZ71 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RTEL1Q9NZ71 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RTEL1Q9NZ71 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RTEL1Q9NZ71 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms