Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY47

CACNA2D2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D2Q9NY47 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms