Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms