Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms