Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms