Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TDP1Q9NUW8 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TDP1Q9NUW8 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TDP1Q9NUW8 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TDP1Q9NUW8 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TDP1Q9NUW8 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TDP1Q9NUW8 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TDP1Q9NUW8 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TDP1Q9NUW8 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TDP1Q9NUW8 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TDP1Q9NUW8 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TDP1Q9NUW8 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TDP1Q9NUW8 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TDP1Q9NUW8 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TDP1Q9NUW8 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TDP1Q9NUW8 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TDP1Q9NUW8 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TDP1Q9NUW8 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TDP1Q9NUW8 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TDP1Q9NUW8 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TDP1Q9NUW8 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TDP1Q9NUW8 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TDP1Q9NUW8 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TDP1Q9NUW8 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TDP1Q9NUW8 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TDP1Q9NUW8 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TDP1Q9NUW8 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TDP1Q9NUW8 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TDP1Q9NUW8 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TDP1Q9NUW8 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TDP1Q9NUW8 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TDP1Q9NUW8 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TDP1Q9NUW8 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TDP1Q9NUW8 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TDP1Q9NUW8 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TDP1Q9NUW8 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TDP1Q9NUW8 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TDP1Q9NUW8 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TDP1Q9NUW8 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TDP1Q9NUW8 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TDP1Q9NUW8 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TDP1Q9NUW8 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TDP1Q9NUW8 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TDP1Q9NUW8 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TDP1Q9NUW8 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TDP1Q9NUW8 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TDP1Q9NUW8 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TDP1Q9NUW8 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TDP1Q9NUW8 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TDP1Q9NUW8 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TDP1Q9NUW8 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TDP1Q9NUW8 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TDP1Q9NUW8 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TDP1Q9NUW8 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TDP1Q9NUW8 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TDP1Q9NUW8 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TDP1Q9NUW8 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TDP1Q9NUW8 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TDP1Q9NUW8 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TDP1Q9NUW8 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TDP1Q9NUW8 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TDP1Q9NUW8 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TDP1Q9NUW8 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TDP1Q9NUW8 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TDP1Q9NUW8 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TDP1Q9NUW8 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TDP1Q9NUW8 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TDP1Q9NUW8 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TDP1Q9NUW8 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TDP1Q9NUW8 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TDP1Q9NUW8 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TDP1Q9NUW8 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TDP1Q9NUW8 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TDP1Q9NUW8 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TDP1Q9NUW8 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TDP1Q9NUW8 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TDP1Q9NUW8 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TDP1Q9NUW8 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TDP1Q9NUW8 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TDP1Q9NUW8 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TDP1Q9NUW8 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TDP1Q9NUW8 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TDP1Q9NUW8 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TDP1Q9NUW8 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TDP1Q9NUW8 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TDP1Q9NUW8 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TDP1Q9NUW8 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TDP1Q9NUW8 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TDP1Q9NUW8 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TDP1Q9NUW8 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TDP1Q9NUW8 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TDP1Q9NUW8 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TDP1Q9NUW8 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TDP1Q9NUW8 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TDP1Q9NUW8 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TDP1Q9NUW8 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TDP1Q9NUW8 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TDP1Q9NUW8 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TDP1Q9NUW8 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TDP1Q9NUW8 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
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