Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTG1

PKDREJ, Polycystic kidney disease and receptor for egg jelly-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDREJQ9NTG1 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms