Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

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Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LTBP3Q9NS15 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LTBP3Q9NS15 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LTBP3Q9NS15 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LTBP3Q9NS15 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LTBP3Q9NS15 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LTBP3Q9NS15 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LTBP3Q9NS15 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LTBP3Q9NS15 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LTBP3Q9NS15 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LTBP3Q9NS15 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LTBP3Q9NS15 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LTBP3Q9NS15 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
LTBP3Q9NS15 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LTBP3Q9NS15 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LTBP3Q9NS15 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LTBP3Q9NS15 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LTBP3Q9NS15 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LTBP3Q9NS15 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LTBP3Q9NS15 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LTBP3Q9NS15 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LTBP3Q9NS15 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LTBP3Q9NS15 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LTBP3Q9NS15 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LTBP3Q9NS15 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LTBP3Q9NS15 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LTBP3Q9NS15 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
LTBP3Q9NS15 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LTBP3Q9NS15 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LTBP3Q9NS15 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LTBP3Q9NS15 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LTBP3Q9NS15 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LTBP3Q9NS15 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LTBP3Q9NS15 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LTBP3Q9NS15 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
LTBP3Q9NS15 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LTBP3Q9NS15 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LTBP3Q9NS15 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LTBP3Q9NS15 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LTBP3Q9NS15 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LTBP3Q9NS15 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LTBP3Q9NS15 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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LTBP3Q9NS15 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
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LTBP3Q9NS15 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
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LTBP3Q9NS15 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LTBP3Q9NS15 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LTBP3Q9NS15 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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LTBP3Q9NS15 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LTBP3Q9NS15 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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LTBP3Q9NS15 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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LTBP3Q9NS15 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LTBP3Q9NS15 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LTBP3Q9NS15 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LTBP3Q9NS15 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LTBP3Q9NS15 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LTBP3Q9NS15 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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LTBP3Q9NS15 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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LTBP3Q9NS15 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LTBP3Q9NS15 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
LTBP3Q9NS15 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LTBP3Q9NS15 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
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LTBP3Q9NS15 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
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LTBP3Q9NS15 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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LTBP3Q9NS15 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LTBP3Q9NS15 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
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LTBP3Q9NS15 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LTBP3Q9NS15 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LTBP3Q9NS15 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LTBP3Q9NS15 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LTBP3Q9NS15 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LTBP3Q9NS15 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LTBP3Q9NS15 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LTBP3Q9NS15 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LTBP3Q9NS15 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LTBP3Q9NS15 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LTBP3Q9NS15 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LTBP3Q9NS15 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LTBP3Q9NS15 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LTBP3Q9NS15 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LTBP3Q9NS15 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LTBP3Q9NS15 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
LTBP3Q9NS15 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
LTBP3Q9NS15 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
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