Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms