Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP55

BPIFA1, BPI fold-containing family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA1Q9NP55 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BPIFA1Q9NP55 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BPIFA1Q9NP55 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BPIFA1Q9NP55 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BPIFA1Q9NP55 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BPIFA1Q9NP55 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BPIFA1Q9NP55 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BPIFA1Q9NP55 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BPIFA1Q9NP55 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BPIFA1Q9NP55 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BPIFA1Q9NP55 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BPIFA1Q9NP55 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BPIFA1Q9NP55 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BPIFA1Q9NP55 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BPIFA1Q9NP55 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
BPIFA1Q9NP55 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
BPIFA1Q9NP55 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
BPIFA1Q9NP55 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BPIFA1Q9NP55 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.45
BPIFA1Q9NP55 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
BPIFA1Q9NP55 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BPIFA1Q9NP55 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BPIFA1Q9NP55 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BPIFA1Q9NP55 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BPIFA1Q9NP55 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BPIFA1Q9NP55 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BPIFA1Q9NP55 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BPIFA1Q9NP55 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BPIFA1Q9NP55 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
BPIFA1Q9NP55 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
BPIFA1Q9NP55 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
BPIFA1Q9NP55 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
BPIFA1Q9NP55 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BPIFA1Q9NP55 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BPIFA1Q9NP55 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BPIFA1Q9NP55 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
BPIFA1Q9NP55 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BPIFA1Q9NP55 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BPIFA1Q9NP55 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BPIFA1Q9NP55 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BPIFA1Q9NP55 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BPIFA1Q9NP55 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BPIFA1Q9NP55 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BPIFA1Q9NP55 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BPIFA1Q9NP55 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BPIFA1Q9NP55 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BPIFA1Q9NP55 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BPIFA1Q9NP55 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BPIFA1Q9NP55 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BPIFA1Q9NP55 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BPIFA1Q9NP55 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BPIFA1Q9NP55 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BPIFA1Q9NP55 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
BPIFA1Q9NP55 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BPIFA1Q9NP55 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BPIFA1Q9NP55 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BPIFA1Q9NP55 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BPIFA1Q9NP55 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BPIFA1Q9NP55 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BPIFA1Q9NP55 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BPIFA1Q9NP55 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BPIFA1Q9NP55 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BPIFA1Q9NP55 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BPIFA1Q9NP55 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BPIFA1Q9NP55 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BPIFA1Q9NP55 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BPIFA1Q9NP55 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BPIFA1Q9NP55 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BPIFA1Q9NP55 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BPIFA1Q9NP55 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BPIFA1Q9NP55 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BPIFA1Q9NP55 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BPIFA1Q9NP55 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
BPIFA1Q9NP55 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BPIFA1Q9NP55 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BPIFA1Q9NP55 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BPIFA1Q9NP55 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BPIFA1Q9NP55 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BPIFA1Q9NP55 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BPIFA1Q9NP55 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BPIFA1Q9NP55 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BPIFA1Q9NP55 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BPIFA1Q9NP55 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BPIFA1Q9NP55 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BPIFA1Q9NP55 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BPIFA1Q9NP55 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BPIFA1Q9NP55 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BPIFA1Q9NP55 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BPIFA1Q9NP55 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BPIFA1Q9NP55 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BPIFA1Q9NP55 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BPIFA1Q9NP55 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BPIFA1Q9NP55 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BPIFA1Q9NP55 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BPIFA1Q9NP55 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BPIFA1Q9NP55 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BPIFA1Q9NP55 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BPIFA1Q9NP55 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BPIFA1Q9NP55 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BPIFA1Q9NP55 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms