Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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CTDSP1Q9GZU7 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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CTDSP1Q9GZU7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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