Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms