Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D3

ZYG11B, Protein zyg-11 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZYG11BQ9C0D3 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZYG11BQ9C0D3 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZYG11BQ9C0D3 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZYG11BQ9C0D3 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZYG11BQ9C0D3 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZYG11BQ9C0D3 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZYG11BQ9C0D3 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZYG11BQ9C0D3 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZYG11BQ9C0D3 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZYG11BQ9C0D3 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZYG11BQ9C0D3 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZYG11BQ9C0D3 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZYG11BQ9C0D3 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZYG11BQ9C0D3 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZYG11BQ9C0D3 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZYG11BQ9C0D3 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ZYG11BQ9C0D3 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZYG11BQ9C0D3 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZYG11BQ9C0D3 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZYG11BQ9C0D3 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZYG11BQ9C0D3 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZYG11BQ9C0D3 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZYG11BQ9C0D3 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZYG11BQ9C0D3 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZYG11BQ9C0D3 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZYG11BQ9C0D3 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZYG11BQ9C0D3 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ZYG11BQ9C0D3 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ZYG11BQ9C0D3 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZYG11BQ9C0D3 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZYG11BQ9C0D3 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZYG11BQ9C0D3 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZYG11BQ9C0D3 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZYG11BQ9C0D3 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZYG11BQ9C0D3 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZYG11BQ9C0D3 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ZYG11BQ9C0D3 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZYG11BQ9C0D3 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZYG11BQ9C0D3 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZYG11BQ9C0D3 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZYG11BQ9C0D3 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZYG11BQ9C0D3 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZYG11BQ9C0D3 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZYG11BQ9C0D3 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ZYG11BQ9C0D3 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZYG11BQ9C0D3 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZYG11BQ9C0D3 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZYG11BQ9C0D3 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZYG11BQ9C0D3 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZYG11BQ9C0D3 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZYG11BQ9C0D3 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZYG11BQ9C0D3 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZYG11BQ9C0D3 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZYG11BQ9C0D3 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZYG11BQ9C0D3 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZYG11BQ9C0D3 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZYG11BQ9C0D3 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZYG11BQ9C0D3 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZYG11BQ9C0D3 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZYG11BQ9C0D3 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZYG11BQ9C0D3 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ZYG11BQ9C0D3 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZYG11BQ9C0D3 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZYG11BQ9C0D3 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ZYG11BQ9C0D3 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZYG11BQ9C0D3 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZYG11BQ9C0D3 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZYG11BQ9C0D3 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZYG11BQ9C0D3 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZYG11BQ9C0D3 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZYG11BQ9C0D3 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZYG11BQ9C0D3 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ZYG11BQ9C0D3 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ZYG11BQ9C0D3 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZYG11BQ9C0D3 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ZYG11BQ9C0D3 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZYG11BQ9C0D3 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZYG11BQ9C0D3 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ZYG11BQ9C0D3 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZYG11BQ9C0D3 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZYG11BQ9C0D3 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ZYG11BQ9C0D3 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZYG11BQ9C0D3 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZYG11BQ9C0D3 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZYG11BQ9C0D3 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZYG11BQ9C0D3 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZYG11BQ9C0D3 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZYG11BQ9C0D3 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZYG11BQ9C0D3 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZYG11BQ9C0D3 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZYG11BQ9C0D3 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZYG11BQ9C0D3 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZYG11BQ9C0D3 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZYG11BQ9C0D3 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZYG11BQ9C0D3 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZYG11BQ9C0D3 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZYG11BQ9C0D3 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZYG11BQ9C0D3 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZYG11BQ9C0D3 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZYG11BQ9C0D3 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms