Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms