Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM5Q9C035 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM5Q9C035 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM5Q9C035 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM5Q9C035 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM5Q9C035 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM5Q9C035 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM5Q9C035 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM5Q9C035 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM5Q9C035 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM5Q9C035 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM5Q9C035 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM5Q9C035 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM5Q9C035 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM5Q9C035 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM5Q9C035 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM5Q9C035 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM5Q9C035 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM5Q9C035 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM5Q9C035 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM5Q9C035 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM5Q9C035 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM5Q9C035 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM5Q9C035 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM5Q9C035 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM5Q9C035 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM5Q9C035 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM5Q9C035 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM5Q9C035 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM5Q9C035 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM5Q9C035 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM5Q9C035 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM5Q9C035 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM5Q9C035 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM5Q9C035 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM5Q9C035 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM5Q9C035 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM5Q9C035 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM5Q9C035 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM5Q9C035 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM5Q9C035 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM5Q9C035 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM5Q9C035 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM5Q9C035 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM5Q9C035 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM5Q9C035 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM5Q9C035 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM5Q9C035 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM5Q9C035 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM5Q9C035 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM5Q9C035 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM5Q9C035 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM5Q9C035 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM5Q9C035 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM5Q9C035 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM5Q9C035 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM5Q9C035 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM5Q9C035 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM5Q9C035 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM5Q9C035 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM5Q9C035 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM5Q9C035 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM5Q9C035 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM5Q9C035 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM5Q9C035 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM5Q9C035 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM5Q9C035 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM5Q9C035 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM5Q9C035 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM5Q9C035 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM5Q9C035 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM5Q9C035 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM5Q9C035 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM5Q9C035 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM5Q9C035 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM5Q9C035 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM5Q9C035 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM5Q9C035 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM5Q9C035 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM5Q9C035 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM5Q9C035 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM5Q9C035 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM5Q9C035 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM5Q9C035 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM5Q9C035 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM5Q9C035 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM5Q9C035 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM5Q9C035 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM5Q9C035 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM5Q9C035 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM5Q9C035 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM5Q9C035 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM5Q9C035 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM5Q9C035 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM5Q9C035 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM5Q9C035 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM5Q9C035 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM5Q9C035 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM5Q9C035 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM5Q9C035 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms