Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms