Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms