Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWT1

CDCA7, Cell division cycle-associated protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA7Q9BWT1 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CDCA7Q9BWT1 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDCA7Q9BWT1 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDCA7Q9BWT1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDCA7Q9BWT1 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CDCA7Q9BWT1 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDCA7Q9BWT1 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDCA7Q9BWT1 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDCA7Q9BWT1 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDCA7Q9BWT1 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDCA7Q9BWT1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDCA7Q9BWT1 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CDCA7Q9BWT1 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CDCA7Q9BWT1 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDCA7Q9BWT1 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDCA7Q9BWT1 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CDCA7Q9BWT1 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDCA7Q9BWT1 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDCA7Q9BWT1 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDCA7Q9BWT1 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDCA7Q9BWT1 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDCA7Q9BWT1 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CDCA7Q9BWT1 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CDCA7Q9BWT1 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CDCA7Q9BWT1 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDCA7Q9BWT1 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDCA7Q9BWT1 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDCA7Q9BWT1 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDCA7Q9BWT1 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDCA7Q9BWT1 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDCA7Q9BWT1 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDCA7Q9BWT1 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDCA7Q9BWT1 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDCA7Q9BWT1 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDCA7Q9BWT1 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDCA7Q9BWT1 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDCA7Q9BWT1 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CDCA7Q9BWT1 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CDCA7Q9BWT1 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDCA7Q9BWT1 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDCA7Q9BWT1 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDCA7Q9BWT1 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDCA7Q9BWT1 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDCA7Q9BWT1 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDCA7Q9BWT1 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CDCA7Q9BWT1 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDCA7Q9BWT1 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDCA7Q9BWT1 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDCA7Q9BWT1 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDCA7Q9BWT1 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDCA7Q9BWT1 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDCA7Q9BWT1 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDCA7Q9BWT1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDCA7Q9BWT1 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDCA7Q9BWT1 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDCA7Q9BWT1 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDCA7Q9BWT1 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDCA7Q9BWT1 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDCA7Q9BWT1 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDCA7Q9BWT1 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDCA7Q9BWT1 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDCA7Q9BWT1 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDCA7Q9BWT1 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDCA7Q9BWT1 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDCA7Q9BWT1 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDCA7Q9BWT1 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDCA7Q9BWT1 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDCA7Q9BWT1 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDCA7Q9BWT1 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDCA7Q9BWT1 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CDCA7Q9BWT1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDCA7Q9BWT1 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDCA7Q9BWT1 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDCA7Q9BWT1 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDCA7Q9BWT1 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDCA7Q9BWT1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDCA7Q9BWT1 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDCA7Q9BWT1 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDCA7Q9BWT1 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CDCA7Q9BWT1 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDCA7Q9BWT1 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDCA7Q9BWT1 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDCA7Q9BWT1 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDCA7Q9BWT1 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDCA7Q9BWT1 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDCA7Q9BWT1 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDCA7Q9BWT1 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDCA7Q9BWT1 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CDCA7Q9BWT1 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDCA7Q9BWT1 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDCA7Q9BWT1 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDCA7Q9BWT1 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDCA7Q9BWT1 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDCA7Q9BWT1 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDCA7Q9BWT1 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDCA7Q9BWT1 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDCA7Q9BWT1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDCA7Q9BWT1 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDCA7Q9BWT1 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDCA7Q9BWT1 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms