Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms