Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG9

PTDSS2, Phosphatidylserine synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS2Q9BVG9 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTDSS2Q9BVG9 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTDSS2Q9BVG9 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTDSS2Q9BVG9 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTDSS2Q9BVG9 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTDSS2Q9BVG9 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTDSS2Q9BVG9 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTDSS2Q9BVG9 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTDSS2Q9BVG9 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTDSS2Q9BVG9 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTDSS2Q9BVG9 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTDSS2Q9BVG9 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTDSS2Q9BVG9 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTDSS2Q9BVG9 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTDSS2Q9BVG9 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTDSS2Q9BVG9 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PTDSS2Q9BVG9 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTDSS2Q9BVG9 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTDSS2Q9BVG9 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTDSS2Q9BVG9 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTDSS2Q9BVG9 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTDSS2Q9BVG9 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTDSS2Q9BVG9 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTDSS2Q9BVG9 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTDSS2Q9BVG9 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTDSS2Q9BVG9 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTDSS2Q9BVG9 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTDSS2Q9BVG9 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTDSS2Q9BVG9 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTDSS2Q9BVG9 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTDSS2Q9BVG9 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTDSS2Q9BVG9 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTDSS2Q9BVG9 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTDSS2Q9BVG9 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTDSS2Q9BVG9 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTDSS2Q9BVG9 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTDSS2Q9BVG9 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PTDSS2Q9BVG9 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTDSS2Q9BVG9 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTDSS2Q9BVG9 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTDSS2Q9BVG9 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTDSS2Q9BVG9 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTDSS2Q9BVG9 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTDSS2Q9BVG9 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PTDSS2Q9BVG9 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTDSS2Q9BVG9 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTDSS2Q9BVG9 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTDSS2Q9BVG9 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTDSS2Q9BVG9 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTDSS2Q9BVG9 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTDSS2Q9BVG9 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PTDSS2Q9BVG9 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTDSS2Q9BVG9 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTDSS2Q9BVG9 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTDSS2Q9BVG9 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTDSS2Q9BVG9 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTDSS2Q9BVG9 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTDSS2Q9BVG9 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTDSS2Q9BVG9 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTDSS2Q9BVG9 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTDSS2Q9BVG9 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTDSS2Q9BVG9 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTDSS2Q9BVG9 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTDSS2Q9BVG9 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTDSS2Q9BVG9 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTDSS2Q9BVG9 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTDSS2Q9BVG9 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTDSS2Q9BVG9 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTDSS2Q9BVG9 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTDSS2Q9BVG9 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTDSS2Q9BVG9 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTDSS2Q9BVG9 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTDSS2Q9BVG9 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTDSS2Q9BVG9 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PTDSS2Q9BVG9 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PTDSS2Q9BVG9 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTDSS2Q9BVG9 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTDSS2Q9BVG9 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTDSS2Q9BVG9 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTDSS2Q9BVG9 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTDSS2Q9BVG9 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTDSS2Q9BVG9 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTDSS2Q9BVG9 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTDSS2Q9BVG9 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTDSS2Q9BVG9 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTDSS2Q9BVG9 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTDSS2Q9BVG9 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTDSS2Q9BVG9 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTDSS2Q9BVG9 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTDSS2Q9BVG9 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTDSS2Q9BVG9 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTDSS2Q9BVG9 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTDSS2Q9BVG9 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTDSS2Q9BVG9 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PTDSS2Q9BVG9 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTDSS2Q9BVG9 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTDSS2Q9BVG9 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTDSS2Q9BVG9 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTDSS2Q9BVG9 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTDSS2Q9BVG9 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms