Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTF0

THUMPD2, THUMP domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD2Q9BTF0 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
THUMPD2Q9BTF0 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
THUMPD2Q9BTF0 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
THUMPD2Q9BTF0 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
THUMPD2Q9BTF0 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
THUMPD2Q9BTF0 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
THUMPD2Q9BTF0 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
THUMPD2Q9BTF0 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
THUMPD2Q9BTF0 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
THUMPD2Q9BTF0 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
THUMPD2Q9BTF0 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
THUMPD2Q9BTF0 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
THUMPD2Q9BTF0 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
THUMPD2Q9BTF0 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
THUMPD2Q9BTF0 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
THUMPD2Q9BTF0 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
THUMPD2Q9BTF0 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
THUMPD2Q9BTF0 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
THUMPD2Q9BTF0 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
THUMPD2Q9BTF0 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
THUMPD2Q9BTF0 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
THUMPD2Q9BTF0 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
THUMPD2Q9BTF0 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
THUMPD2Q9BTF0 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
THUMPD2Q9BTF0 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
THUMPD2Q9BTF0 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
THUMPD2Q9BTF0 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
THUMPD2Q9BTF0 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
THUMPD2Q9BTF0 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
THUMPD2Q9BTF0 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
THUMPD2Q9BTF0 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
THUMPD2Q9BTF0 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
THUMPD2Q9BTF0 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
THUMPD2Q9BTF0 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
THUMPD2Q9BTF0 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
THUMPD2Q9BTF0 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
THUMPD2Q9BTF0 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
THUMPD2Q9BTF0 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
THUMPD2Q9BTF0 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
THUMPD2Q9BTF0 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
THUMPD2Q9BTF0 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
THUMPD2Q9BTF0 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
THUMPD2Q9BTF0 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
THUMPD2Q9BTF0 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
THUMPD2Q9BTF0 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
THUMPD2Q9BTF0 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
THUMPD2Q9BTF0 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
THUMPD2Q9BTF0 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms