Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
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