Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms