Protein–RNA interactions for Protein: Q99836

MYD88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYD88Q99836 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MYD88Q99836 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MYD88Q99836 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MYD88Q99836 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MYD88Q99836 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MYD88Q99836 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MYD88Q99836 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MYD88Q99836 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MYD88Q99836 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MYD88Q99836 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MYD88Q99836 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MYD88Q99836 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MYD88Q99836 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MYD88Q99836 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MYD88Q99836 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MYD88Q99836 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MYD88Q99836 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MYD88Q99836 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MYD88Q99836 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MYD88Q99836 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MYD88Q99836 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MYD88Q99836 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MYD88Q99836 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MYD88Q99836 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MYD88Q99836 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MYD88Q99836 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MYD88Q99836 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MYD88Q99836 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms