Protein–RNA interactions for Protein: Q96T66

NMNAT3, Nicotinamide/nicotinic acid mononucleotide adenylyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMNAT3Q96T66 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms